Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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