Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
IKZF1Q13422 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms