Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEUP1Q05D60 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms