Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSPL2Q05D32 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms