Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPN12Q05209 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms