Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMC1P62191 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMC1P62191 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms