Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK8P49336 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK8P49336 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK8P49336 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms