Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCC3P46736 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms