Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFSF9P41273 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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