Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MLH1P40692 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms