Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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PTPRMP28827 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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PTPRMP28827 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PTPRMP28827 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PTPRMP28827 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PTPRMP28827 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PTPRMP28827 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRMP28827 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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