Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGA4P13612 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ITGA4P13612 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms