Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTMAP06454 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTMAP06454 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTMAP06454 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTMAP06454 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms