Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LRRTM2O43300 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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