Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRIM38O00635 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRIM38O00635 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRIM38O00635 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRIM38O00635 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRIM38O00635 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRIM38O00635 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRIM38O00635 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRIM38O00635 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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