Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms