Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F8A0AVK6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms