Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM30AQ9NV96 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms