Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.1 ms