Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms