Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CELF4Q9BZC1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms