Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SPANXD-201ENST00000370515 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF451-205ENST00000370710 375 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL162724.1-201ENST00000437461 373 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC16A7-209ENST00000549465 537 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC121757.1-201ENST00000552441 624 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC134312.5-202ENST00000562705 756 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC015688.5-201ENST00000584605 603 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms