Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf16Q9BUW7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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C9orf16Q9BUW7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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