Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PDE9A-207ENST00000398224 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PDE9A-210ENST00000398229 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 LINC00969-213ENST00000445707 2363 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 TMPRSS3-201ENST00000291532 3193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C2orf88Q9BSF0 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms