Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms