Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF3C6Q969F1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms