Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNERQ8NFT8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms