Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LNX2Q8N448 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LNX2Q8N448 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LNX2Q8N448 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LNX2Q8N448 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LNX2Q8N448 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LNX2Q8N448 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LNX2Q8N448 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LNX2Q8N448 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LNX2Q8N448 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LNX2Q8N448 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LNX2Q8N448 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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