Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC50Q8IVM0 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms