Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.2 ms