Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms