Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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ATG16L1Q676U5 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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ATG16L1Q676U5 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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ATG16L1Q676U5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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ATG16L1Q676U5 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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ATG16L1Q676U5 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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