Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PTPRNQ16849 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PTPRNQ16849 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PTPRNQ16849 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PTPRNQ16849 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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