Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RTN1Q16799 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTN1Q16799 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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