Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNGA3Q16281 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms