Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms