Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CUL3Q13618 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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CUL3Q13618 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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