Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MTMR3Q13615 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms