Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 MAN2C1-215ENST00000563596 675 ntTSL 39.65□□□□□ -0.864e-17■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-28■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 ORMDL1-206ENST00000458355 914 ntTSL 316.66■□□□□ 0.262e-28■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-28■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.82e-28■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 ORMDL1-205ENST00000442547 893 ntTSL 55.45□□□□□ -1.542e-28■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.742e-28■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 LRRC75B-204ENST00000460524 2276 ntTSL 530.48■■■□□ 2.474e-10■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 LRRC75B-203ENST00000446942 1828 ntTSL 527.83■■■□□ 2.054e-10■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 LRRC75B-202ENST00000404045 1417 ntTSL 325.41■■□□□ 1.664e-10■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 LRRC75B-207ENST00000491910 2943 ntTSL 224.62■■□□□ 1.534e-10■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.444e-10■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 TRIM24-203ENST00000464210 545 ntTSL 45.44□□□□□ -1.542e-19■□□□□ 8.7
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SF3A3Q12874 ADGRG6-212ENST00000540208 652 ntTSL 34.58□□□□□ -1.684e-10■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 C19orf48-214ENST00000602125 292 ntTSL 55.29□□□□□ -1.563e-7■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 PTCD3-215ENST00000484203 928 ntTSL 25.26□□□□□ -1.573e-6■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 PTCD3-213ENST00000480102 589 ntTSL 44.18□□□□□ -1.743e-6■□□□□ 8.7
SF3A3Q12874 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.921e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.91e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.871e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 SEC13-207ENST00000397105 883 ntTSL 219.05■□□□□ 0.641e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 SEC13-217ENST00000482647 782 ntTSL 219.05■□□□□ 0.641e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.391e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 TRIM28-209ENST00000597423 733 ntTSL 314.71□□□□□ -0.052e-23■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 LRP5-207ENST00000533695 267 ntTSL 314.6□□□□□ -0.071e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.271e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.371e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 TCP1-207ENST00000536807 873 ntTSL 212.65□□□□□ -0.384e-12■□□□□ 8.6
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SF3A3Q12874 FUBP1-213ENST00000492724 583 ntTSL 312.29□□□□□ -0.441e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 ZNF514-204ENST00000496060 5593 ntTSL 1 (best)11.72□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 APOL2-201ENST00000249066 2685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.611e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 SENP6-204ENST00000436928 595 ntTSL 510.91□□□□□ -0.661e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 TMEM63A-208ENST00000496025 789 ntTSL 210.76□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 8.6
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SF3A3Q12874 GDI2-202ENST00000380181 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.711e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 APOL2-202ENST00000358502 2551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 AC087632.1-209ENST00000634259 825 ntTSL 59.72□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 8.6
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SF3A3Q12874 MERTK-205ENST00000449344 771 ntTSL 39.21□□□□□ -0.941e-6■□□□□ 8.6
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SF3A3Q12874 APOL2-209ENST00000529194 611 ntTSL 38.84□□□□□ -0.991e-6■□□□□ 8.6
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SF3A3Q12874 SLMAP-220ENST00000495364 1383 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 APOL2-204ENST00000454728 577 ntTSL 48.54□□□□□ -1.041e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 TMEM63A-204ENST00000482753 405 ntTSL 38.28□□□□□ -1.081e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 CSNK2A1-210ENST00000619801 655 ntTSL 38.23□□□□□ -1.091e-6■□□□□ 8.6
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SF3A3Q12874 TRIM28-210ENST00000597618 609 ntTSL 27.99□□□□□ -1.132e-23■□□□□ 8.6
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SF3A3Q12874 SLMAP-205ENST00000417128 3066 ntTSL 1 (best)7.76□□□□□ -1.171e-6■□□□□ 8.6
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SF3A3Q12874 AC087632.1-210ENST00000635593 668 ntTSL 57.6□□□□□ -1.191e-6■□□□□ 8.6
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SF3A3Q12874 AC087632.1-208ENST00000635511 920 ntTSL 57.17□□□□□ -1.261e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.271e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 PCLAF-204ENST00000558043 689 ntTSL 26.93□□□□□ -1.31e-6■□□□□ 8.6
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SF3A3Q12874 AC087632.1-201ENST00000634251 1973 ntTSL 1 (best)6.36□□□□□ -1.391e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 AC087632.1-205ENST00000635704 670 ntTSL 36.35□□□□□ -1.391e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.471e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 SENP6-203ENST00000424947 2685 ntTSL 25.46□□□□□ -1.541e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 AC087632.1-202ENST00000634847 1821 ntTSL 55.42□□□□□ -1.541e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 SENP6-209ENST00000485497 941 ntTSL 45.24□□□□□ -1.571e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.571e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 AC087632.1-203ENST00000634318 1033 ntTSL 55.07□□□□□ -1.61e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 AC087632.1-212ENST00000635413 706 ntTSL 55□□□□□ -1.611e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 PNN-204ENST00000554902 583 ntTSL 24.9□□□□□ -1.631e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 PNN-206ENST00000557680 912 ntTSL 34.9□□□□□ -1.631e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 FUBP1-206ENST00000474632 639 ntTSL 24.88□□□□□ -1.631e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 CNOT1-205ENST00000563283 551 ntTSL 34.8□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.671e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 P4HA1-206ENST00000464310 415 ntTSL 54.6□□□□□ -1.671e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 AC087632.1-214ENST00000635320 568 ntTSL 44.36□□□□□ -1.711e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 GDI2-205ENST00000447751 834 ntTSL 34.24□□□□□ -1.731e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 AC087632.1-206ENST00000635605 757 ntTSL 54.15□□□□□ -1.751e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 FUBP1-211ENST00000489495 2156 ntTSL 23.92□□□□□ -1.781e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 SENP6-208ENST00000483859 1013 ntTSL 33.74□□□□□ -1.811e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 FUBP1-208ENST00000483894 605 ntTSL 23.71□□□□□ -1.821e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 FUBP1-207ENST00000480673 262 ntTSL 33.6□□□□□ -1.831e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.851e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 AC087632.1-215ENST00000558783 726 ntTSL 53.44□□□□□ -1.861e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 AC087632.1-207ENST00000634529 372 ntTSL 43.08□□□□□ -1.921e-6■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 512.64□□□□□ -0.391e-25■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 46.2□□□□□ -1.421e-25■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.063e-7■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.163e-7■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 LGR5-206ENST00000550851 4095 ntTSL 212.76□□□□□ -0.373e-7■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 LGR5-203ENST00000540815 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.433e-7■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.098e-15■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 HNRNPH1-226ENST00000515446 368 ntTSL 214.09□□□□□ -0.151e-8■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 WDR33-205ENST00000436787 822 ntTSL 511.71□□□□□ -0.538e-15■□□□□ 8.6
SF3A3Q12874 WDR33-204ENST00000409658 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.568e-15■□□□□ 8.6
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