Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 C1S-221ENST00000617865 2844 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PKD2L1-201ENST00000318222 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PJA1-204ENST00000374584 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SLC3A1-202ENST00000409229 2909 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms