Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
OC90Q02509 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
OC90Q02509 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
OC90Q02509 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
OC90Q02509 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms