Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBA1P69905 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBA1P69905 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBA1P69905 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBA1P69905 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBA1P69905 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HBA1P69905 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBA1P69905 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBA1P69905 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HBA1P69905 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms