Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.8 ms