Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF6P49848 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF6P49848 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF6P49848 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF6P49848 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF6P49848 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF6P49848 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF6P49848 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF6P49848 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF6P49848 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF6P49848 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF6P49848 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF6P49848 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms