Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AFMP43652 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AFMP43652 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AFMP43652 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AFMP43652 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AFMP43652 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AFMP43652 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AFMP43652 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AFMP43652 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
AFMP43652 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AFMP43652 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AFMP43652 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AFMP43652 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AFMP43652 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AFMP43652 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms