Protein–RNA interactions for Protein: P43362

MAGEA9, Melanoma-associated antigen 9, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA9P43362 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAGEA9P43362 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms