Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 AP000692.1-201ENST00000397184 596 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP1P23763 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms