Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FGFR3P22607 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms