Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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