Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCP1P17987 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCP1P17987 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCP1P17987 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCP1P17987 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms